上清丸為常用的清熱解毒中成藥。平時較為常見的有：上清丸、黃連上清丸、牛黃上清丸、芎菊上清丸等。所謂“上清”，意指“清上焦之熱”，臨床常用于上呼吸道感染所導致的發熱、疼痛。

所有種類的上清丸一般具有的成分為：黃芩、梔子（用于清熱）、白芷、防風、荊芥（用于祛風止痛），性偏寒。以水丸劑型居多。一般的上清丸還有大黃、黃柏等成分。

中醫理論認為，“三焦”為五臟六腑之一，“三焦”是上焦、中焦、下焦的合稱。

上、中、下三焦部位的劃分為：

上焦：一般將膈以上的胸部，包括心、肺兩臟，以及頭面部，稱為上焦。中焦：是指膈以下、臍以上的上腹部，包括脾胃和肝膽等臟腑。下焦：一般以臍下的部位為下焦，包括小腸、大腸、腎、膀胱、女子胞、精室等臟腑以及兩下肢。三焦的總體功能是通行諸氣和運行水液。三焦的病理表現一般為實火之證，需用清熱解毒藥祛濕瀉火。。

上清丸善清上焦之火，具有清熱散風，解毒，通便的功效，臨床上主要用于頭暈耳鳴、目赤、鼻竇炎、口舌生瘡，牙齦腫痛，大便秘結。

上清丸經過加減方之后，可具有不同的偏性，使其更為適宜治療某類疾病。

1、上清丸對感冒所致的輕度發熱、咽喉腫痛效果較好。同時由于方中含有大黃等藥物，又可清下焦之熱，故對小便黃赤、大便秘結等療效顯著。

2、黃連上清丸在上清丸的基礎上加黃連、石膏、蔓荊子、旋覆花等，前兩者清熱能力較強；蔓荊子可疏風、散熱、止痛；旋覆花可清痰降氣。故適用于上呼吸道感染所致的中重度發熱，咽喉、口腔炎癥疼痛較甚，而且有咳嗽痰多癥狀者。

3、牛黃上清丸牛黃上清丸是在黃連上清丸的基礎上加牛黃和冰片。牛黃是寒涼之品；冰片具有開竅醒神的作用。故對感冒發熱，而且伴有昏沉癥狀者效果較好。但老年人、便溏者、孕婦不宜服用。

4、芎菊上清丸芎菊上清丸是在上清丸的基礎上去大黃、黃柏，加羌活、藁本，具有祛風止痛的作用，故對頭痛有效，如偏頭痛、三叉神經痛、叢集性頭痛、癲癇頭痛等。

不同的上清丸具有的共性是：皆屬偏寒性藥物，可能會影響消化功能，故消化功能不良者（如年老體弱）應慎用。在服藥期也應該注意不要食用辛辣刺激的食物。孕婦忌服。